
圖:白細(xì)胞增多癥病人與正常人精子中的rsRNA-28S有顯著差異。
相比正常精子,白細(xì)胞增多癥病人精子rsRNA-28S的Upperband顯著缺失,這或能作為一種新的臨床精子檢測(cè)Marker。
5月10日,國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《分子細(xì)胞生物學(xué)雜志》(JMolCellBiol)在線發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所張永蓮研究組的最新研究成果:Asequenceof28SrRNA-derivedsmallRNAsisenrichedinmaturespermandvarioussomatictissuesandpossiblyassociateswithinflammation。
近年來(lái),除了miRNAs和piRNAs,其他種類(lèi)的小非編碼(sncRNAs)被不斷發(fā)現(xiàn),例如來(lái)源于tRNA的tsRNAs。rRNA作為細(xì)胞中另一種重要housekeepingRNA,是否也能產(chǎn)生類(lèi)似tsRNAs的小RNA?目前仍缺乏深入研究。
在研究員張永蓮和副研究員周玉傳的指導(dǎo)下,助理研究員儲(chǔ)辰、余璐等人對(duì)小鼠精子中的小非編碼RNA進(jìn)行深入研究,發(fā)現(xiàn)一個(gè)來(lái)源于28SrRNA,序列特點(diǎn)上與已知tsRNAs十分相似的sncRNA(rsRNA-28S)。
進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),小鼠現(xiàn)有基因組數(shù)據(jù)中并不包含rsRNA-28S所對(duì)應(yīng)的DNA序列信息,在前人利用RNA-seq對(duì)小鼠精子小RNA的研究中,常規(guī)的genomemapping方式對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行處理時(shí)將rsRNA-28S誤認(rèn)為無(wú)法mapping的垃圾序列而丟棄。
通過(guò)定量實(shí)驗(yàn),研究人員發(fā)現(xiàn)rsRNA-28S在小鼠精子中的豐度甚至高于已知的tsRNAs,同時(shí)其還在多個(gè)體細(xì)胞中存在表達(dá)。體細(xì)胞的rsRNA-28S能響應(yīng)LPS刺激發(fā)生表達(dá)改變,而對(duì)數(shù)十例人精子樣品的篩查發(fā)現(xiàn),生殖道炎癥病人白細(xì)胞增多癥精子中的rsRNA-28S發(fā)生了顯著變化。
這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)了一個(gè)和已知tsRNAs十分類(lèi)似的rsRNA,揭示了現(xiàn)有g(shù)enomemapping方法在小RNA測(cè)序分析中的不足,并探索了rsRNA-28S的功能。這些結(jié)果提示細(xì)胞中可能存在一類(lèi)“housekeepingRNA-derived”小RNAs,而并非僅僅是來(lái)自tRNA的tsRNA。
該研究工作得到了研究員陳德桂、劉默芳、王紅艷,上海市計(jì)劃生育研究所研究員施惠娟以及法國(guó)ClermontUniversité教授Jo?lR.Drevet的大力協(xié)助,并得到了國(guó)家自然科學(xué)基金委、科技部的研究經(jīng)費(fèi)資助及生化與細(xì)胞所分子生物學(xué)技術(shù)平臺(tái)的支持。
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