
Science:腫瘤免疫治療,基于菌群的精準(zhǔn)醫(yī)療時(shí)代來(lái)臨
Science[IF:37.205]
①臨床前動(dòng)物模型中,細(xì)菌可調(diào)節(jié)化療及免疫療法的抗癌效果,近期研究關(guān)注人體腸道菌群對(duì)抗癌藥物的影響;②PD-1單抗對(duì)于肺癌、腎癌等上皮細(xì)胞腫瘤的療效受腸道菌群影響,抗生素顯著降低患者的平均生存期,Akk菌可能改善PD-1單抗的療效;③PD-1單抗治療黑色素瘤的效果與腸道菌群組成相關(guān),柔嫩梭菌豐度較高的患者無(wú)進(jìn)展生存期較長(zhǎng);④PD-1單抗治療轉(zhuǎn)移性黑色素瘤的效果與腸道菌群相關(guān),長(zhǎng)雙歧桿菌、產(chǎn)氣柯林斯菌和屎腸球菌的豐度影響療效。
Precisionmedicineusingmicrobiota
2018-01-05DOI:10.1126/science.aar2946

Science:患者腸道菌群構(gòu)成,顯著影響抗PD-1療法的效果!
Science[IF:37.205]
①用16S測(cè)序、宏基因組測(cè)序、定量PCR的綜合方法,分析了42名轉(zhuǎn)移性黑色素瘤患者的糞菌構(gòu)成;②患者的菌群構(gòu)成和抗PD-1免疫療法的效果之間存在顯著關(guān)聯(lián),在對(duì)療法響應(yīng)較好的患者菌群中,鑒定出長(zhǎng)雙歧桿菌、產(chǎn)氣柯林斯菌和屎腸球菌等豐度較高;③給無(wú)菌小鼠移植這些患者的糞菌,可明顯改善腫瘤控制、增強(qiáng)T細(xì)胞應(yīng)答,獲得更好的抗PD-1療效;④菌群構(gòu)成可影響癌癥患者的抗腫瘤免疫,也可作為預(yù)測(cè)患者能否響應(yīng)免疫檢查點(diǎn)阻斷療法的生物標(biāo)志物。
Thecommensalmicrobiomeisassociatedwithanti–PD-1efficacyinmetastaticmelanomapatients
2018-01-05DOI:10.1126/science.aao3290

Science:腸道菌給力,腫瘤免疫療法實(shí)現(xiàn)PFS成倍增加!
Science[IF:37.205]
?、俜治?12名接受抗PD-1免疫抑制劑治療的黑色素瘤患者的口腔和腸道菌群,緩解(R)與非緩解(NR)組的腸道菌群顯著不同;②平均無(wú)進(jìn)展生存期(PFS):R-232天,NR-188天;③對(duì)其中43名患者(30R,13NR),R患者的瘤胃菌科細(xì)菌的α多樣性和相對(duì)豐度顯著較高,腸道細(xì)菌的功能顯著不同;④柔嫩梭菌(瘤胃菌科)豐度最高組,PFS達(dá)393天,擬桿菌豐度最高組,PFS僅188天;⑤R患者的全身和抗腫瘤免疫均增強(qiáng),且將糞菌移植到無(wú)菌小鼠也確認(rèn)類似情形。
Gutmicrobiomemodulatesresponsetoanti–PD-1immunotherapyinmelanomapatients
2017-11-02DOI:10.1126/science.aan4236

Science:抗PD-1抑制劑+腸道Akk菌↑,腫瘤生存期升84%!
Science[IF:37.205]
?、俜治?49名患肺癌、腎癌等腫瘤并接受抗PD-1免疫抑制劑治療的患者,69名同時(shí)接受廣譜抗生素(ATB);②ATB患者平均總生存期為8.3個(gè)月,遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于非ATB患者的15.3個(gè)月;③患者體內(nèi)Akkermansiamuciniphila(Akk菌)的相對(duì)豐度與對(duì)免疫檢查點(diǎn)抑制劑(ICI)的響應(yīng)顯著相關(guān);④將對(duì)ICI響應(yīng)患者的糞菌移植給無(wú)菌小鼠,可以改善PD-1抑制劑對(duì)小鼠腫瘤的效果;⑤將對(duì)ICI不響應(yīng)患者糞菌移植給無(wú)菌小鼠,后者口服Akk菌后,能恢復(fù)對(duì)PD-1抑制劑的響應(yīng)。
GutmicrobiomeinfluencesefficacyofPD-1–basedimmunotherapyagainstepithelialtumors
2017-11-02DOI:10.1126/science.aan3706

Science:腸道中的ILC2可遷移至肺部,幫助宿主抵抗寄生蟲
Science[IF:37.205]
?、傺装Y性2型天然淋巴細(xì)胞(iILC2)可由IL-25或寄生蟲誘導(dǎo)產(chǎn)生,為循環(huán)細(xì)胞,來(lái)源于腸道固有層中的靜息態(tài)ILC2;②ILC2的遷移依賴于1-磷酸鞘氨醇(S1P)介導(dǎo)的趨化反應(yīng),后者促進(jìn)ILC2進(jìn)入淋巴管,并通過血液循環(huán)在積累于外周組織(包括肺部)中;③由腸道進(jìn)入肺部的iILC2與在肺部定居的nILC2不同,iILC2可促進(jìn)抗寄生蟲防御及組織修復(fù);④ILC2的擴(kuò)增與遷移與抗原引起的適應(yīng)性免疫反應(yīng)中的淋巴細(xì)胞增殖與遷移相似,提示ILC是適應(yīng)性免疫的補(bǔ)充。
S1P-dependentinterorgantraffickingofgroup2innatelymphoidcellssupportshostdefense
2018-01-05DOI:10.1126/science.aam5809

Science:肺炎可能起源于腸道?
Science[IF:37.205]
①天然淋巴細(xì)胞(ILC),參與機(jī)體的穩(wěn)態(tài)和哮喘等病理過程;②Huang等證實(shí),IL-25誘導(dǎo)ILC2從腸道遷移至肺部,即通過ILC2的腸-肺募集軸參與“2型免疫”;③炎癥性(iILC2)通過淋巴系統(tǒng)循環(huán)入血,可通過淋巴-上皮屏障;④iILC2和nILC2在肺內(nèi)發(fā)揮不同的作用,iILC2由腸道募集于肺參與快速和一過性2型免疫,而nILC2主要常駐于組織,對(duì)病毒感染進(jìn)行應(yīng)答;⑤1-磷酸鞘氨醇(S1P)受體S1P1抑制劑ozanimod可用于慢性炎癥性肺疾病,如哮喘、COPD等。
Lunginflammationoriginatinginthegut
2018-01-05DOI:10.1126/science.aar4301

FI:腸道菌群產(chǎn)生的丙酸或在自閉癥中有潛在作用
FrontiersinImmunology[IF:6.429]
①自閉癥患者的淋巴母細(xì)胞系(LCL)存在線粒體功能障礙(AD-A)和正常(AD-N)兩個(gè)類群;②丙酸對(duì)健康人LCL及患者的AD-N型LCL的免疫基因表達(dá)影響甚微;③丙酸可顯著激活自閉癥患者的AD-A型LCL的免疫相關(guān)基因,更多類型和數(shù)量的免疫相關(guān)基因的表達(dá)發(fā)生改變,特別是人白細(xì)胞抗原和免疫球蛋白的表達(dá)顯著上調(diào);④盡管細(xì)胞實(shí)驗(yàn)有劑量效應(yīng)、組織特異性等問題,該結(jié)果提示腸道菌代謝產(chǎn)物可激活代謝異常的LCL的非典型免疫反應(yīng)。
Modulationofimmunologicalpathwaysinlymphoblastoidcelllinesbytheentericmicrobiomemetabolitepropionicacid
2017-12-22DOI:10.3389/fimmu.2017.01670

CR:免疫因素通過影響病原體以改變宿主的菌群組成
CellReports[IF:8.282]
?、俜治霏h(huán)境因素在適應(yīng)性免疫缺陷小鼠(Rag2-/-)和Nlrp6缺陷小鼠(一種參與調(diào)節(jié)菌群組成的免疫傳感器)中對(duì)菌群形成的影響;②在常規(guī)飼養(yǎng)的Nlrp6-/-小鼠中,家族性傳播對(duì)菌群組成有顯著影響;③SPF條件下,野生型、Nlrp6-/-和Rag2-/-小鼠有相似的菌群;④宿主免疫對(duì)菌群的影響可通過引入病原體來(lái)檢測(cè),基因型、環(huán)境因素和生態(tài)因素共同影響菌群定殖;⑤Nlrp6以及適應(yīng)性免疫對(duì)菌群組成的影響依賴于群落結(jié)構(gòu),且主要影響病原體而非共生菌群。
ShapingofIntestinalMicrobiotainNlrp6-andRag2-DeficientMiceDependsonCommunityStructure
2017-12-26DOI:10.1016/j.celrep.2017.12.027

Microbiome:飼料中添加丁酸鈉改善魚類的腸道菌群及抗病能力
Microbiome[IF:8.496]
?、俚停?.8%)植物飼料添加飼養(yǎng)的真骨魚,在細(xì)菌感染后可幸存下來(lái);②而高植物飼料添加可增加寄生蟲感染水平,降低生長(zhǎng)狀況和腸道菌群多樣性,誘導(dǎo)發(fā)光細(xì)菌屬占優(yōu)勢(shì)菌,改變腸道黏膜蛋白質(zhì)組成并影響腸道功能;③在高植物飼料中添加0.4%丁酸鈉,可稍微降低真骨魚細(xì)菌感染后的累積死亡率,避免寄生蟲寄生后的生長(zhǎng)遲緩現(xiàn)象,腸道菌群多樣性和產(chǎn)丁酸菌增加,并逆轉(zhuǎn)植物飼料引起的腸道蛋白質(zhì)組成的變化;④結(jié)果可為魚類飼料添加方案提供參考。
Undercontrol:howadietaryadditivecanrestorethegutmicrobiomeandproteomicprofile,andimprovediseaseresilienceinamarineteleosteanfishfedvegetablediets
2017-12-28DOI:10.1186/s40168-017-0390-3

Nature子刊:多種方法助菌群因果性研究
NatureMicrobiology[IF:N/A]
①高通量方法可分析腸道菌群與宿主生理和疾病的相關(guān)性,但仍需其它方法來(lái)明確機(jī)制;②Surana等采用菌群-表型三角剖分的新方法鑒定因果性微生物;③已開發(fā)交叉菌群培養(yǎng)、生物信息學(xué)等方法鑒定導(dǎo)致特定表型的功能性微生物、分析控制關(guān)鍵過程的代謝產(chǎn)物;④很多表型可能涉及多種菌的共同作用,目前尚無(wú)充分有效的培養(yǎng)方法和篩選微生物組合的能力;⑤將來(lái)可進(jìn)行功能缺失性實(shí)驗(yàn),選擇性清除微生物或抑制其產(chǎn)物,有助于鑒定引起特定表型的微生物。
Assigningfunctiontosymbionts
2018-01-01DOI:10.1038/s41564-017-0088-0

Nature:新方法,促進(jìn)菌群研究從相關(guān)到因果!
Nature[IF:40.137]
?、僭诮Y(jié)腸炎小鼠模型中定殖不同菌群,生存狀況各異,共飼養(yǎng)讓菌群有交流,小鼠展現(xiàn)出結(jié)腸炎中度敏感性;②利用“微生物-表型三角剖分法”,發(fā)現(xiàn)毛螺菌科可防止疾病,通過定向微生物培養(yǎng)技術(shù),明確Clostridiumimmunis阻止結(jié)腸炎傾向性小鼠死亡;③該方法具有普適性,利用它成功鑒定幾種誘導(dǎo)一種腸道抗菌肽表達(dá)的共生菌;④對(duì)完全不同的表型,該方法將相關(guān)性微生物組分析“升格”為因果性微生物鑒定,預(yù)計(jì)可在人類微生物組研究中被廣泛應(yīng)用。
Movingbeyondmicrobiome-wideassociationstocausalmicrobeidentification
2017-12-06DOI:10.1038/nature25019

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