最新一期《科學》雜志刊登了哈佛大學華人科學家陳崇毅課題組的突破性研究成果:一種名叫“轉(zhuǎn)座子插入線性擴增”(LIANTI)的技術(shù),首次實現(xiàn)了全基因組的線性擴增。

陳崇毅博士接受科技日報記者郵件采訪時表示,這一全新技術(shù)能實現(xiàn)高達97%的單細胞基因組覆蓋率,準確度超越了目前在用的所有擴增技術(shù)。
多次退火環(huán)狀循環(huán)擴增技術(shù)(MALBAC)是目前最先進的全基因組擴增技術(shù),能檢測單細胞中較小的DNA序列變異,從而發(fā)現(xiàn)個別細胞之間的遺傳差異。雖然該技術(shù)已經(jīng)用于生殖醫(yī)學臨床,研究和測量胚胎細胞內(nèi)的遺傳變異來篩選健康胚胎,但也只能擴增單細胞中93%的基因組進行測序。
陳崇毅博士對科技日報記者解釋道,LIANTI技術(shù)是通過插入他們團隊專門設(shè)計的一種轉(zhuǎn)座子對單細胞內(nèi)遺傳物質(zhì)擴增。轉(zhuǎn)座子是一類可在基因組中轉(zhuǎn)移位點的DNA片段,他們設(shè)計的新轉(zhuǎn)座子含有一條19個堿基對雙鏈轉(zhuǎn)座酶和一條環(huán)狀單鏈啟動子,啟動子啟動轉(zhuǎn)錄過程后,線性擴增插入位點下游的DNA達到一定數(shù)量后即可進行測序研究。
他們對紫外線引起的人類細胞基因變異進行了擴增檢測,結(jié)果表明,LIANTI首次實現(xiàn)單細胞基因組擴增97%準確率,高于目前最先進擴增技術(shù)MALBAC。
陳崇毅表示,LIANTI減少了擴增噪音和錯誤,因此基因拷貝數(shù)的準確度非常高,比之前技術(shù)提高了3個數(shù)量級。另外,其測量基因組內(nèi)單個堿基突變的靈敏度大大增強,這對單堿基突變導致的大量癌癥與遺傳病的研究和治療具有重要意義。
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