近日,中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院醫(yī)學(xué)中心及中科院天然免疫和慢性疾病重點實驗室教授瞿昆課題組聯(lián)合美國斯坦福大學(xué)HowardChang實驗室,首次揭示了T細胞淋巴瘤(CTCL)的表觀遺傳調(diào)控機制。該研究成果以ChromatinaccessibilitylandscapeofcutaneousTcelllymphomaanddynamicresponsetoHDACinhibitors為題發(fā)表在6月15日的國際期刊《癌細胞》(CancerCell)上。

基因調(diào)控是一個遺傳和表觀遺傳修飾共同作用的復(fù)雜系統(tǒng),對患者的表觀遺傳基因組的深入研究對于在分子層次了解許多疾病的致病機理、優(yōu)化診斷和治療方案都具有非常重要的科學(xué)意義。論文作者以人類T細胞淋巴瘤(CutaneousTcelllymphoma,CTCL)為研究對象,利用一種名為ATAC-seq的新技術(shù)研究CTCL患者個性化表觀遺傳調(diào)控機制及其對藥物敏感性的決定性作用。
CTCL是一種由T淋巴細胞克隆性增生造成的較為罕見的復(fù)雜性疾病,晚期的CTCL如Sézary綜合癥,癌細胞可以轉(zhuǎn)移至血液,導(dǎo)致T細胞白血病,是一種非常致命的疾病。
論文作者通過流式分離正常人和患者新鮮血液中的CD4+T細胞,利用ATAC-seq技術(shù)快速檢測正常人和患者血液中微量活體T淋巴細胞的染色質(zhì)開放位點,整合各類組學(xué)數(shù)據(jù)和生物信息分析技術(shù),深度解析CTCL表觀遺傳指紋,構(gòu)建CTCL腫瘤特異性、患者特異性和細胞特異性基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
作者還通過追蹤患者在組蛋白脫乙酰酶抑制劑(HDACi)抗癌藥物治療過程中各個時間點的表觀遺傳狀態(tài),在時間尺度上深入研究表觀遺傳基因組和關(guān)鍵性轉(zhuǎn)錄因子對患者藥物敏感性的動態(tài)調(diào)控機制,并準確預(yù)測患者對HDACi抗癌藥物的敏感性。
該論文是首個實時構(gòu)建癌癥個性化表觀遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的工作,一方面為研究其他疾病的個性化表觀遺傳調(diào)控機制建立了模板,另一方面為患者的精準醫(yī)療方案提供了科學(xué)依據(jù),因此對推動精準醫(yī)療的發(fā)展有非常重要的科學(xué)意義。
瞿昆為該論文第一作者,中國科大為第一單位。實驗室本科生靳永昊、實驗員金晨也參與了該項工作。該研究得到了中組部、科技部、基金委、中科院和中國科大的經(jīng)費支持。
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