Nat Genet：2018年諾獎(jiǎng)之后科學(xué)家們又發(fā)現(xiàn)免疫療法的新型靶點(diǎn)
doi：10.1038/s41588-018-0251-4
繼2018年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)之后，全球很多研究人員都將目光轉(zhuǎn)移到了腫瘤免疫療法的開發(fā)上。
近日，一項(xiàng)刊登在國(guó)際雜志Nature Genetics上的研究報(bào)告中，來自麥吉爾大學(xué)健康中心的科學(xué)家們通過研究發(fā)現(xiàn)：
一種名為TIM-3的分子在機(jī)體免疫反應(yīng)的調(diào)節(jié)上扮演著關(guān)鍵角色。
這種特殊分子或有望作為一種新型潛在靶點(diǎn)幫助研究人員開發(fā)治療癌癥和其它疾病的新型免疫療法。
研究者發(fā)現(xiàn)，當(dāng)TIM-3蛋白功能處于抑制狀態(tài)或失活時(shí)，機(jī)體免疫系統(tǒng)功能就會(huì)被完全“釋放”，T細(xì)胞就會(huì)失控過量表達(dá)。
從而引發(fā)皮下脂膜炎T淋巴瘤（LTSCP，subcutaneous panniculitis T lymphoma），這種特殊癌癥起源于淋巴細(xì)胞。
文章中，研究者在這種綜合征的疾病起源處發(fā)現(xiàn)了兩種原始的突變，這些突變能直接對(duì)TIM-3發(fā)揮作用，抑制該分子在淋巴細(xì)胞表面表達(dá)，并攻擊癌細(xì)胞。
研究者發(fā)現(xiàn)，這種淋巴瘤相關(guān)的免疫反應(yīng)的過度激活要比他們最初想象中更為普遍。
目前研究人員在東亞人、澳大利亞人、波利尼西亞人及歐洲人身上都發(fā)現(xiàn)了這兩種突變。
同時(shí)研究人員還在這些人群的兄弟姐妹中發(fā)現(xiàn)了相同的罕見淋巴瘤，當(dāng)進(jìn)行基因組測(cè)序后，研究人員發(fā)現(xiàn)：
所有患者都攜帶有HAVCR2基因的相同基因突變。
該基因能編碼TIM-3，其會(huì)通過父母親來傳遞。
Nature Cell：中美科學(xué)家重磅級(jí)發(fā)現(xiàn)！RNA甲基化修飾或能促進(jìn)機(jī)體學(xué)習(xí)和記憶過程
doi：10.1038/s41586-018-0666-1 doi：10.1016/j.cell.2015.04.010
RNA攜帶著DNA編碼的指令片段，其能攜帶蛋白質(zhì)的產(chǎn)生從而完成細(xì)胞內(nèi)的工作。
但這一過程并不總是簡(jiǎn)單明了。
DNA或RNA的化學(xué)修飾會(huì)在不改變實(shí)際遺傳序列的情況下改變基因的表達(dá)狀況。
這種表觀遺傳學(xué)修飾會(huì)影響機(jī)體許多生物學(xué)過程。
比如免疫系統(tǒng)反應(yīng)、神經(jīng)細(xì)胞發(fā)育、多種人類癌癥甚至肥胖等。
其中很多改變實(shí)際上是通過甲基化作用來發(fā)生的，甲基化作用即是將甲基化基團(tuán)添加到DNA或RNA分子上（添加甲基基團(tuán)的蛋白質(zhì)被稱為“書寫者”，而移除甲基化基團(tuán)的蛋白質(zhì)被稱為“橡皮擦”）。
要使得甲基化能夠產(chǎn)生一定的生物學(xué)效應(yīng)，就必須有“解讀器”蛋白質(zhì)來識(shí)別這種變化并與之相結(jié)合。
哺乳動(dòng)物機(jī)體中信使RNA最常見的修飾就是N6-甲基腺苷（m6A）修飾。
m6A廣泛存在于神經(jīng)系統(tǒng)中，其能幫助協(xié)調(diào)多種神經(jīng)生物學(xué)功能，并能通過YTH蛋白家族中的閱讀蛋白來發(fā)揮作用。
近日，一項(xiàng)刊登在國(guó)際雜志Nature上的研究報(bào)告中，來自芝加哥大學(xué)、濱州大學(xué)和中國(guó)上海科技大學(xué)的科學(xué)家們通過聯(lián)合研究發(fā)現(xiàn)：
YTH蛋白家族成員—Ythdf1在機(jī)體學(xué)習(xí)和記憶形成過程中扮演重要的角色，YTH蛋白家族能夠特異性地識(shí)別m6A。
研究者表示，利用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)敲除小鼠機(jī)體中的Ythdf1后，就能夠促進(jìn)m6A修飾的信使RNA對(duì)機(jī)體的學(xué)習(xí)活動(dòng)產(chǎn)生反應(yīng)，并直接引起神經(jīng)細(xì)胞刺激。
Nat Med：母乳喂養(yǎng)和嬰兒配方奶粉喂養(yǎng)或?qū)雰耗c道微生物組影響不同
doi：10.1038/s41591-018-0216-2
嬰兒配方奶粉不僅能在營(yíng)養(yǎng)方面模擬母乳，而且還能在嬰兒消化道中滋養(yǎng)類似腸道菌群的生長(zhǎng)。
諸如此類，微生物對(duì)于維持機(jī)體健康必不可少，其能抵御致病菌對(duì)機(jī)體的影響，同時(shí)還能影響機(jī)體的代謝過程。
并能幫助合成多種維生素和氨基酸來促進(jìn)嬰兒健康生長(zhǎng)發(fā)育。
近日，一項(xiàng)刊登在國(guó)際著名雜志Nature Medicine上的研究報(bào)告中，來自華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院的科學(xué)家們通過研究發(fā)現(xiàn)：
當(dāng)嬰兒配方奶粉和母乳都能促進(jìn)嬰兒腸道中相似種類細(xì)菌生長(zhǎng)的同時(shí)，這些細(xì)菌所表現(xiàn)出的“工作方式”卻并不盡相同。
目前研究人員并不清楚這些差異對(duì)嬰兒機(jī)體健康的影響。
研究者Gautam Dantas教授說道，嬰兒配方奶粉的制造商會(huì)不斷地調(diào)整奶粉原料，其能成功找到正確的細(xì)菌組合。
但截至目前為止，幾乎所有的研究都重點(diǎn)關(guān)注細(xì)菌的成分和種類，而對(duì)于細(xì)菌如何發(fā)揮作用并沒有進(jìn)行相關(guān)研究。
這項(xiàng)研究中，研究人員通過研究發(fā)現(xiàn)，細(xì)菌看似相同，實(shí)則其發(fā)揮著不同的功能。
文章中，研究人員對(duì)來自60名嬰兒腸道中細(xì)菌的完整DNA進(jìn)行分析來鑒別每一個(gè)嬰兒腸道微生物組的成員，腸道微生物組是生存在機(jī)體消化道中的細(xì)菌群落。
研究人員分析了腸道菌群能夠合成且破碎的氨基酸和其它生物性分析，腸道菌群能夠釋放代謝副產(chǎn)物來影響宿主機(jī)體的生理學(xué)功能。
包括營(yíng)養(yǎng)、炎癥和消化系統(tǒng)健康。
Nat Commun：僅需一滴血！一種基于手機(jī)的設(shè)備就可檢測(cè)HIV-1
doi：10.1038/s41467-018-06727-8
人類免疫缺陷病毒HIV-1通過攻擊健康的免疫細(xì)胞削弱人體的免疫系統(tǒng)，從而導(dǎo)致獲得性免疫缺陷綜合征（AIDS，俗稱艾滋?。?。
在缺乏基礎(chǔ)設(shè)施和訓(xùn)練有素的醫(yī)療專業(yè)人員的發(fā)展中國(guó)家，控制HIV-1仍然是一個(gè)重大的全球健康挑戰(zhàn)。
傳統(tǒng)的HIV-1病毒監(jiān)測(cè)方法是比較昂貴的，需要使用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PCR）。
早期檢測(cè)HIV-1是阻止疾病進(jìn)展和傳播的關(guān)鍵，但是它需要長(zhǎng)期的監(jiān)測(cè)，這對(duì)那些必須前往診所或醫(yī)院的家庭來說可能是一個(gè)負(fù)擔(dān)。
在一項(xiàng)新的研究中，為了解決這個(gè)問題，美國(guó)布萊根婦女醫(yī)院的Hadi Shafiee博士及其團(tuán)隊(duì)利用納米技術(shù)、微芯片（microchip）、手機(jī)和三維打印的手機(jī)附件，開發(fā)出一種便攜式的可負(fù)擔(dān)得起的移動(dòng)診斷工具，
這種工具能夠在醫(yī)療資源有限的地區(qū)用于測(cè)試和監(jiān)測(cè)HIV-1。
這種快速的基于手機(jī)的診斷平臺(tái)代表著一種診斷急性病毒感染的新方法，從而可能降低病毒傳播風(fēng)險(xiǎn)。
此外，它也可能用于檢測(cè)早期的治療失敗。相關(guān)研究結(jié)果近期發(fā)表在Nature Communications期刊上。
Immunity：突破！新型抗體有望治療多種類型癌癥
doi：10.1016/j.immuni.2018.09.014
近日，一項(xiàng)刊登在國(guó)際雜志Immunity上的研究報(bào)告中，來自南安普敦大學(xué)的科學(xué)家們通過研究開發(fā)了一種新抗體，其或能幫助闡明癌癥抵御機(jī)體免疫系統(tǒng)的奧秘。
文章中，研究人員對(duì)抗體進(jìn)行工程化改造使其能夠靶向作用免疫受體4-1BB，該受體能夠激活殺傷性T細(xì)胞來尋找并破壞癌細(xì)胞。
4-1BB是一種免疫療法靶點(diǎn)，其主要存在于腫瘤中調(diào)節(jié)性T細(xì)胞上。
而調(diào)節(jié)性T細(xì)胞能夠關(guān)閉殺傷性T細(xì)胞的功能，同時(shí)殺傷性T細(xì)胞也能表達(dá)4-1BB，但表達(dá)程度較低。
研究人員在臨床前腫瘤模型中設(shè)定了一種4-1BB抗體，其能夠剔除調(diào)節(jié)性T細(xì)胞從而促進(jìn)導(dǎo)致腫瘤消退。
然而，因?yàn)檫@種抗體非常擅長(zhǎng)剔除調(diào)節(jié)性T細(xì)胞而并不擅長(zhǎng)刺激殺傷性T細(xì)胞。
因此，研究人員似乎并不可能利用這類規(guī)則的抗體來調(diào)節(jié)疾病的治療手段。
Cell：重磅！中國(guó)科學(xué)家開發(fā)出有望根治成人惡性腦瘤的新療法！
doi：10.1016/j.cell.2018.09.038
sGBM（secondary glioblastoma，繼發(fā)性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤）是一種罕見的成年人腦瘤。
每年的該病的發(fā)生率為百萬分之二至百萬分之五，比如以香港的750萬人口為參照的話。
那么，每年將會(huì)有超過15人被診斷為繼發(fā)性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤。
這種腫瘤起初是從包圍脊柱和大腦的神經(jīng)細(xì)胞周圍低級(jí)別的神經(jīng)膠質(zhì)瘤（LGG）開始發(fā)生的，患者的5年生存率低于10%。
目前研究人員利用名為替莫唑胺（TMZ）的化療藥物來治療繼發(fā)性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤，而該療法首先在歐洲被開發(fā)。
在21世紀(jì)初期開始被廣泛使用，藥物替莫唑胺會(huì)誘發(fā)腫瘤細(xì)胞出現(xiàn)非特異性的DNA損傷，從而抑制腫瘤再生和擴(kuò)散。
然而歷史和患者數(shù)據(jù)顯示，接受替莫唑胺治療的繼發(fā)性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者幾乎總是會(huì)出現(xiàn)病情復(fù)發(fā)的狀況。
而且腫瘤所表現(xiàn)出的突變會(huì)讓腫瘤躲避第二輪替莫唑胺的治療，并對(duì)化療產(chǎn)生耐受性，因此研究人員就需要尋找更好的治療手段。
Front Neurosci：坐實(shí)！喝咖啡真的能夠降低阿爾茲海默病和帕金森疾病的患病風(fēng)險(xiǎn)！
doi：10.3389/fnins.2018.00735
每年全球大約會(huì)消費(fèi)5000億杯咖啡。
近日，一項(xiàng)刊登在國(guó)際雜志Frontiers in Neuroscience 上的研究報(bào)告中，來自加拿大Krembil研究所的科學(xué)家們通過研究發(fā)現(xiàn)：
喝咖啡或能幫助降低個(gè)體患阿爾茲海默病和帕金森疾病的風(fēng)險(xiǎn)。
研究者Donald Weaver說道，攝入咖啡似乎并不會(huì)讓我們患上阿爾茲海默病和帕金森疾病，但我們想知道其中的原因是什么。
是否是因?yàn)榭Х戎械哪承┗衔锇l(fā)揮了關(guān)鍵作用，從而能幫助減緩年齡相關(guān)的機(jī)體認(rèn)知力下降。
文章中，研究人員對(duì)三種不同類型的咖啡進(jìn)行了研究，分別是淺烘焙咖啡（light roast）、焦炒咖啡（dark roast）和無咖啡因的焦炒咖啡（decaffeinated dark roast）。
Nature：重大發(fā)現(xiàn)！腸道菌群或能控制機(jī)體的運(yùn)動(dòng)方式！
doi：10.1038/s41586-018-0634-9
近日，一項(xiàng)刊登在國(guó)際雜志Nature上的研究報(bào)告中，來自加州理工學(xué)院的科學(xué)家們通過研究對(duì)“跟著直覺走”的含義進(jìn)行了新的詮釋。
文章中，研究者發(fā)現(xiàn)，腸道菌群能夠控制果蠅的運(yùn)動(dòng)，同時(shí)他們還鑒別出了參與整個(gè)過程的特殊神經(jīng)元。
相關(guān)研究結(jié)果或能闡明機(jī)體腸道和大腦之間的關(guān)聯(lián)，尤其是能夠闡明腸道菌群影響機(jī)體行為（包括運(yùn)動(dòng)）的分子機(jī)制。
研究者Sarkis K. Mazmanian教授表示，我們觀察到不攜帶細(xì)菌的無菌果蠅常常會(huì)異?；钴S。
相比攜帶正常水平微生物的果蠅而言，這些果蠅會(huì)走得更快，更遠(yuǎn)，而且休息的時(shí)間也更短。
文章中，研究人員調(diào)查了腸道菌群影響果蠅行為的通路。
運(yùn)動(dòng)對(duì)于機(jī)體的一系列活動(dòng)都非常重要，比如交配、尋找食物等。
研究結(jié)果表明，腸道菌群或許對(duì)于動(dòng)物機(jī)體的基礎(chǔ)行為非常重要。
果蠅攜帶著5-20種不同的菌群，這項(xiàng)研究中，研究人員利用每一種細(xì)菌處理無菌果蠅。
結(jié)果發(fā)現(xiàn)，當(dāng)果蠅接觸短乳桿菌時(shí)，其移動(dòng)速度就會(huì)降低至正常水平。
因此短乳桿菌或許就是能夠恢復(fù)無菌果蠅正常行為的其中一種關(guān)鍵細(xì)菌。
同時(shí)研究者還發(fā)現(xiàn)，一種名為木糖異構(gòu)酶（xylose isomerase，XI）的分子對(duì)于該過程非常重要。
因?yàn)槎倘闂U菌中存在木糖異構(gòu)酶，且該酶能夠分解糖類，利用木糖異構(gòu)酶來處理果蠅就足以減緩其運(yùn)動(dòng)速度。
Science：著名華人學(xué)者莊小威再發(fā)力作，構(gòu)建出下丘腦視前區(qū)的細(xì)胞空間圖譜
doi：10.1126/science.aau5324
科學(xué)家們?cè)缇鸵庾R(shí)到為了研究大腦，就必須了解組成大腦的細(xì)胞。
如果獲取一塊大腦組織，研究組織中細(xì)胞表達(dá)的基因，這可發(fā)現(xiàn)大腦組織中存在多少種細(xì)胞類型，但是這仍然會(huì)留下一大大問題：
為了研究這些細(xì)胞表達(dá)的基因，需要將它們從大腦組織中脫離下來，然而，這會(huì)丟失寶貴的信息---它們是如何在組織中組裝在一起的。
因此，如果人們想要真正地理解大腦，就需要了解大腦中的細(xì)胞所在的空間環(huán)境。
不同于肝臟或其他器官的是，大腦的不同尋常之處在于大腦中的細(xì)胞以一種對(duì)稱的形式進(jìn)行組裝。
因此在研究一塊大腦組織時(shí)，應(yīng)當(dāng)不僅能夠觀察這種組織中有哪些細(xì)胞類型，而且還能夠觀察它們?cè)谀睦?，它們周圍有哪些類型的?xì)胞。
在一項(xiàng)新的研究中，通過使用MERFISH，Zhuang與哈佛大學(xué)的Catherine Dulac教授合作，著手解決那些長(zhǎng)期困擾著試圖理解大腦運(yùn)作方式的科學(xué)家們的問題。
相關(guān)研究結(jié)果于2018年11月1日在線發(fā)表在Science期刊上。
Cell：構(gòu)建出人類免疫細(xì)胞圖譜，可確定遺傳變異對(duì)基因表達(dá)的影響
doi：10.1016/j.cell.2018.10.022
比較任何兩個(gè)人的DNA，你會(huì)發(fā)現(xiàn)他們的遺傳密碼中的數(shù)百萬個(gè)位點(diǎn)存在著不同。
如今，在一項(xiàng)新的研究中，來自美國(guó)拉霍亞免疫學(xué)研究所（LJI）的研究人員分享了大量數(shù)據(jù)。
這些數(shù)據(jù)對(duì)于破譯這種自然遺傳變異如何影響免疫系統(tǒng)保護(hù)我們健康的能力至關(guān)重要。
相關(guān)研究結(jié)果于2018年11月15日在線發(fā)表在Cell期刊上。
四年多來，在Pandurangan Vijayanand博士的領(lǐng)導(dǎo)下，這些研究人員一直在進(jìn)行大規(guī)模的免疫分析工作。
并詳細(xì)說明了DNA序列中的變異如何影響不同類型免疫細(xì)胞中的基因活性。
他們正在通過一個(gè)新的數(shù)據(jù)庫(kù)DICE（Database of Immune Cell Expression， Expression of quantitative trait loci and Epigenomics， 即免疫細(xì)胞表達(dá)、數(shù)量性狀座位表達(dá)和表觀基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)）來分享他們的發(fā)現(xiàn)。
這使得世界各地的科學(xué)家們輕松地探究這些數(shù)據(jù)，這是因?yàn)樗鼈兣c基因、細(xì)胞類型或者疾病存在關(guān)聯(lián)。
為了確定遺傳變異對(duì)免疫系統(tǒng)的影響，Vijayanand及其同事們產(chǎn)生了15種類型免疫細(xì)胞的基因活性譜。
其中這15種類型的免疫細(xì)胞發(fā)表著在91名健康供者中每個(gè)人的血液中發(fā)現(xiàn)的最為豐富的細(xì)胞類型。
他們的研究結(jié)果揭示了遺傳變異對(duì)免疫系統(tǒng)中基因活性的深遠(yuǎn)影響。對(duì)12000多個(gè)基因---大約占這些細(xì)胞中所有活性基因的60％---而言，天然存在的遺傳變異與某些細(xì)胞類型中基因活性的顯著差異相關(guān)。
Vijayanand說，“我們觀察到的效應(yīng)大小是令人吃驚的。這不是一些微小變化?！?/p>
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